MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acaryochloris marina MBIC11017 plasmid pREB3

Total Repeats: 4865

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_009928	GGAT	2	8	196527	196534	25 %	25 %	50 %	0 %	158340348
3502	NC_009928	CGGA	2	8	196577	196584	25 %	0 %	50 %	25 %	158340348
3503	NC_009928	ATTG	2	8	196585	196592	25 %	50 %	25 %	0 %	158340348
3504	NC_009928	GGA	2	6	196786	196791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158340348
3505	NC_009928	AGG	2	6	196868	196873	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158340348
3506	NC_009928	GGC	2	6	196874	196879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158340348
3507	NC_009928	AGTT	2	8	196886	196893	25 %	50 %	25 %	0 %	158340348
3508	NC_009928	CTTTC	2	10	196998	197007	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
3509	NC_009928	AAT	2	6	197018	197023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_009928	GGA	2	6	197123	197128	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_009928	GGAG	2	8	197147	197154	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_009928	AG	3	6	197153	197158	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_009928	ACT	2	6	197169	197174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3514	NC_009928	GGA	2	6	197192	197197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_009928	TGA	2	6	197214	197219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_009928	TCT	2	6	197236	197241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3517	NC_009928	T	6	6	197403	197408	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_009928	CAGG	3	12	197448	197459	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3519	NC_009928	CGAT	2	8	197470	197477	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3520	NC_009928	CAA	2	6	197484	197489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3521	NC_009928	ATA	2	6	197505	197510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_009928	TAAG	2	8	197541	197548	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_009928	TCTG	2	8	197552	197559	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3524	NC_009928	GGT	2	6	197575	197580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_009928	T	7	7	197626	197632	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_009928	AGC	2	6	197637	197642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3527	NC_009928	TTC	2	6	197652	197657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3528	NC_009928	TTC	2	6	197687	197692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3529	NC_009928	TTA	2	6	197756	197761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_009928	TCT	2	6	197825	197830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3531	NC_009928	C	6	6	197895	197900	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3532	NC_009928	AATC	2	8	197935	197942	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3533	NC_009928	TGC	2	6	198026	198031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3534	NC_009928	TAT	2	6	198100	198105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_009928	AGA	2	6	198145	198150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340349
3536	NC_009928	AAG	2	6	198188	198193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340349
3537	NC_009928	GAT	2	6	198226	198231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340349
3538	NC_009928	AAC	2	6	198250	198255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340349
3539	NC_009928	CAG	2	6	198321	198326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340349
3540	NC_009928	CAA	2	6	198401	198406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340349
3541	NC_009928	GCT	2	6	198560	198565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340349
3542	NC_009928	AGA	2	6	198621	198626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340349
3543	NC_009928	AGT	2	6	198654	198659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_009928	AT	3	6	198674	198679	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_009928	CTC	2	6	198701	198706	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3546	NC_009928	TA	3	6	198760	198765	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_009928	CTT	2	6	198785	198790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3548	NC_009928	TAG	2	6	198791	198796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_009928	CAG	2	6	198859	198864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3550	NC_009928	CAGT	2	8	198896	198903	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3551	NC_009928	CAC	2	6	198908	198913	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3552	NC_009928	AGT	2	6	198920	198925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_009928	A	7	7	198937	198943	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_009928	CCT	2	6	198990	198995	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158340350
3555	NC_009928	GAA	2	6	199019	199024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340350
3556	NC_009928	CTG	2	6	199045	199050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340350
3557	NC_009928	TGG	2	6	199062	199067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158340350
3558	NC_009928	CAA	2	6	199079	199084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340350
3559	NC_009928	GAT	2	6	199114	199119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340350
3560	NC_009928	TCA	2	6	199236	199241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340350
3561	NC_009928	AAT	2	6	199247	199252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158340350
3562	NC_009928	GAT	2	6	199279	199284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340350
3563	NC_009928	T	6	6	199297	199302	0 %	100 %	0 %	0 %	158340350
3564	NC_009928	CTT	2	6	199303	199308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340350
3565	NC_009928	TGA	2	6	199315	199320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340350
3566	NC_009928	ACG	2	6	199415	199420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340350
3567	NC_009928	ATT	2	6	199574	199579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_009928	TTA	2	6	199603	199608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_009928	AGAGAA	2	12	199612	199623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3570	NC_009928	TTA	2	6	199754	199759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158340351
3571	NC_009928	GGAC	2	8	199776	199783	25 %	0 %	50 %	25 %	158340351
3572	NC_009928	AGC	2	6	199788	199793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340351
3573	NC_009928	AGC	2	6	199835	199840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340351
3574	NC_009928	CTC	2	6	199967	199972	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158340351
3575	NC_009928	GAA	2	6	199987	199992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3576	NC_009928	A	6	6	200100	200105	100 %	0 %	0 %	0 %	158340352
3577	NC_009928	GCCA	2	8	200145	200152	25 %	0 %	25 %	50 %	158340352
3578	NC_009928	GTT	2	6	200332	200337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158340352
3579	NC_009928	ATC	2	6	200462	200467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340353
3580	NC_009928	GGATGG	2	12	200553	200564	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3581	NC_009928	CA	3	6	200597	200602	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3582	NC_009928	A	7	7	200675	200681	100 %	0 %	0 %	0 %	158340354
3583	NC_009928	AGT	2	6	200690	200695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340354
3584	NC_009928	ATG	2	6	200730	200735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340354
3585	NC_009928	TGG	2	6	200750	200755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158340354
3586	NC_009928	TCC	2	6	200776	200781	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158340354
3587	NC_009928	GCTGAG	2	12	200816	200827	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	158340354
3588	NC_009928	CTA	2	6	200856	200861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340354
3589	NC_009928	T	6	6	200877	200882	0 %	100 %	0 %	0 %	158340354
3590	NC_009928	GCCA	2	8	200898	200905	25 %	0 %	25 %	50 %	158340354
3591	NC_009928	GCCC	2	8	200958	200965	0 %	0 %	25 %	75 %	158340354
3592	NC_009928	TTA	2	6	201001	201006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158340354
3593	NC_009928	CTT	2	6	201107	201112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3594	NC_009928	GCA	2	6	201138	201143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3595	NC_009928	CTG	2	6	201170	201175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3596	NC_009928	TCAG	2	8	201178	201185	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3597	NC_009928	A	6	6	201269	201274	100 %	0 %	0 %	0 %	158340355
3598	NC_009928	GAA	2	6	201279	201284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340355
3599	NC_009928	ATG	2	6	201425	201430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340356
3600	NC_009928	AATC	2	8	201462	201469	50 %	25 %	0 %	25 %	158340356
3601	NC_009928	TGG	2	6	201606	201611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158340356
3602	NC_009928	ATTACG	2	12	201631	201642	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	158340356
3603	NC_009928	GGAG	2	8	201748	201755	25 %	0 %	75 %	0 %	158340356
3604	NC_009928	AAC	2	6	201785	201790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340356
3605	NC_009928	GAT	3	9	201889	201897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340356
3606	NC_009928	GTT	2	6	201979	201984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158340356
3607	NC_009928	TTC	2	6	202001	202006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340356
3608	NC_009928	AAGCTG	2	12	202010	202021	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	158340356
3609	NC_009928	ATG	2	6	202076	202081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340357
3610	NC_009928	CCAAT	2	10	202147	202156	40 %	20 %	0 %	40 %	158340357
3611	NC_009928	ATG	2	6	202320	202325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340357
3612	NC_009928	ATT	2	6	202358	202363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158340357
3613	NC_009928	GCC	2	6	202398	202403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158340357
3614	NC_009928	GAT	2	6	202421	202426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340357
3615	NC_009928	CCA	2	6	202430	202435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158340357
3616	NC_009928	TTG	2	6	202464	202469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158340357
3617	NC_009928	ATG	2	6	202470	202475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340357
3618	NC_009928	AGCTAC	2	12	202480	202491	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	158340357
3619	NC_009928	GCT	2	6	202502	202507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340357
3620	NC_009928	AGC	3	9	202524	202532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340357
3621	NC_009928	GCT	2	6	202550	202555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340357
3622	NC_009928	GAA	2	6	202601	202606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340357
3623	NC_009928	GTG	2	6	202607	202612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158340357
3624	NC_009928	TGA	2	6	202678	202683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340357
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3626	NC_009928	TAC	2	6	202740	202745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3862	NC_009928	ATCAA	2	10	216916	216925	60 %	20 %	0 %	20 %	158340378
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3870	NC_009928	CAA	2	6	217181	217186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340378
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